- Учредитель – высший орган управления
- Директор – единоличный исполнительный орган
- Попечительский совет – коллегиальный орган управления
- Общее собрание работников – коллегиальный орган управления
- Педагогический совет – коллегиальный орган управления
- Совет слушателей – коллегиальный орган управления
Учреждение имеет структурное подразделение Учебно-тренажёрное судно «Учебный-1», располагаемое в посёлке Октябрьский и управляемое в соответствии с утверждённым Положением. Ответственное лицо — начальник учебно-тренажёрного судна Буделин Максим Александрович.
Контакты структурного подразделения можно найти по этой ссылке